Az akváriumban élő növények és állatok alsóbb osztályainak képviselői
Bármelyik, még a legtisztább akváriumban is, az amatőr által elhelyezett halakon és növényeken kívül számos és sokféle hívatlan vendég telepszik meg - alacsonyabb rendű növények és állatok képviselői. Többnyire ártalmatlanok az akvárium lakosságára, de néhányuk sok gondot okozhat a hobbinak. Mások éppen ellenkezőleg, nagyon kívánatosnak bizonyulnak, segítik a szeretőt tisztán tartani, vagy kiváló étel a sültekhez.
Kürttekercs (Planorbarius corneus)
Különféle baktériumok telepednek meg az akváriumban, hozzájárulva az élelmiszer-maradványok, a halak salakanyagai, az elhalt növényi részek lebomlásához. Előfordul, hogy nagy mennyiségű szerves maradvány felhalmozódása esetén (pl. vágott vérférgekkel való bőséges tápláláskor) hatalmas mennyiségben szaporodnak el, ugyanakkor a víz nagyon zavarossá válik, a benne oldott oxigén mennyisége nem elegendő, a a halak fulladozni kezdenek: a felszínen lebegnek, felfogják a levegőt. A rothadó baktériumok tömeges kifejlődése a víz reakciójának megváltozásával jár együtt, ami gátolja a halak növekedését.
Annak érdekében, hogy megszabaduljon a felesleges baktériumoktól, először el kell távolítania a felesleges szerves anyagokat. Nem szükséges teljesen cserélni a vizet (elég a részleges csere). A rothadó maradványok eltávolítása után a baktériumok szaporodása leáll, és az akváriumban mindig jelenlévő csillók gyorsan megtisztítják a vizet.
Általában mindenben, még egy kis tavacskában is végbemegy a víz öntisztulása, ha a rothadásra képes szerves anyagot nem szállítjuk túlzott mennyiségben. Az öntisztulási folyamat a következő. Az akvárium vizébe helyezett szerves anyagok, például a száraz élelmiszer maradványai 1-2 nap múlva bakteriális zavarosodást okoznak, amely napról napra fokozódik. A különböző típusú rothadó baktériumok egymás után váltakozva, egy ideig (a víz hőmérsékletétől függően) a bomlásra képes szerves anyagokat részben vízben oldódó, részben kicsapódó szervetlen anyagokká alakítják, így a víz teljesen tiszta és átlátszó lesz. Víztisztítás egy akváriumban halakkal - a baktériumok mellett a bicenoforok és a csillós csillók is segítenek. A vízinövények a szerves anyagok mineralizációs termékeinek fogyasztói. Az új, nemrég felszerelt akváriumban az ablak felé néző üvegen zöld pöttyök megjelenése, amelyek fokozatosan meghúzzák az üveget, jelzi az akvárium kialakult biológiai rendszerét. Ez a zöld plakk mikroszkopikus algákból áll, amelyek a baktériumok létfontosságú tevékenységéből származó ásványi anyagok hatására fejlődnek ki.
Euglena zöld alga (Euglena viridis)
Különleges tulajdonságai különböztetik meg az akváriumban több hónapig, sőt évekig tartó változás nélküli állást. Teljes átlátszósággal idővel halvány sárgás árnyalatot kap. Ez a víz szinte nem tartalmaz alacsonyabb rendű állatok és növények képviselőit. A hulladékok és élelmiszer-maradványok formájában megjelenő szerves anyagok, sőt az öreg vízben lévő halak vagy csigák tetemei azonban nem bomlanak le sokáig, a bőrparaziták által sérült vagy érintett halak pedig feltűnően gyorsan felépülnek. Másrészt a víz alatti növények létfontosságú tevékenysége ilyen vízben elnyomódik. Ennek oka a régi vízben található huminsav vegyületek, amelyek sárgás színt és tartósítószert, valamint fertőtlenítő tulajdonságokat adnak.
Nehéz megőrizni a víz tisztaságát, megvédve azt a bakteriális zavarosságtól az ívó halivadékok tenyésztésére szolgáló edényekben, mivel az utóbbiak megeszik a csillós állatokat, megakadályozva, hogy a baktériumok elpusztításához szükséges mennyiségben szaporodjanak. Ezért, ha vágott vérférgekkel táplálkozik, el kell viselnie a bakteriális zavarosságot. Amint az ivadékok elkezdik enni a küklopszokat, a baktériumok fokozatosan eltűnnek, és a csillósok megeszik őket. Ennek a folyamatnak a felgyorsítása érdekében célszerű suvoyokat vagy bryozoákat tartalmazó növényeket elhelyezni az akváriumban.
Az akvárium bomlástermékekkel való eltömődésének megelőzése érdekében hasznos, ha olyan csigák vannak, amelyek megeszik a maradék ételt. A legnagyobb hasznot hozza tekercs (Planorbis).
Néha, különösen nyáron, jó megvilágítás és magas hőmérséklet mellett . A vízvirágzást mikroszkopikus méretű algák okozzák, amelyek gyakran nagy mennyiségben fejlődnek ki az akváriumban. Leggyakrabban megtalálható euglena zöld (Euglena viridis). Néha mikroszkopikus algák is megjelennek, fehéres-zöld ködöt okozva. A baktériumokkal ellentétben a mikroszkopikus algák csak erős fény jelenlétében fejlődnek ki, szaporodásukat bőséges oxigénfelszabadulás kíséri.